チョウが食草を
見分けるしくみを探る
昆虫食性進化研究室
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ラボ日記
メンバー
MacでRNA-seqデータ解析
1. 解析環境の構築
2. シークエンスデータのQC・トリミング・アセンブル
3. Transdecoder による遺伝子予測とアノテーション
4. リード数カウント
5. リードカウントのマトリクスを作成する
6. リードカウントのクオリティチェック
7. DE(発現量比較)解析
8. 発現量が上昇している遺伝子(DEG)のデータを取り出す
おまけ1 Transdecoderをできるだけ自動化する
おまけ2 発現量解析をシェルスクリプトでできるだけ自動化する
年度別活動報告
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更新情報
20.05.06
RNA-seqのアセンブルと発現量比較のプロトコール公開
19.09.25
吉川顧問と海野和男氏の共著、「アゲハチョウの世界ーその進化と多様性」発売
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