3. 尾崎克久（昆虫食性進化研究室）

サナギの翅の部分が黒くなっている個体がいるとのこと、羽化が近いサインなのか、別の要因なのか、とても気になるところかと思いますが、部分的に黒っぽくなった蛹は時々観察されます。

ご質問いただいた「寒さで動かない幼虫の対応」と「休眠の条件」について、提供いただいた情報を整理し、補足を含めて回答いたします。

1. 動きが鈍くなった幼虫の温度管理について
朝晩の冷え込みで幼虫が食べなくなっている場合は、暖かい場所に移動させてあげることをお勧めします。

食べることは最優先: 幼虫にとって、サナギになるための栄養を蓄えることは何よりも重要です。気温が低すぎて活動量が落ち、餌を食べられない状態が続くと、体力を消耗してサナギになれずに死んでしまう可能性があります。

成長を促す: 「温度変化は良くない」というご懸念はもっともですが、この時期に関しては、日中の暖かい時間帯だけでなく、夜間も室内の比較的暖かい場所に置いて、幼虫・前蛹から蛹への成長をサポートしてあげる方が安全です。

2. 休眠と気温・日長の関係について
とても良いところに着目されましたね。結論から申し上げますと、気温も休眠の判断に若干の影響を与えますが、やはり「若齢期に経験した日長」が決定的な要因となります。

日長が最重要（メインスイッチ）
ジャコウアゲハを含め多くの鱗翅目昆虫（チョウとガの仲間）は、若齢幼虫（小さい頃）の時期に「日が短くなってきたな」と感じると、体内で「自分は休眠蛹（きゅうみんよう）になろう」というスイッチが入ります。一度このスイッチが入ると、その後に環境が変わっても覆ることは少ないとされています。

気温の影響（サブ要素）
気温も全く関係ないわけではありません。例えば、日長が「休眠するかどうかの境界線」くらいの際どい短さだった場合、気温が高いと「まだ夏だ」と勘違いして休眠しない蛹になり、気温が低いと「もう冬だ」と判断して休眠する、といった補助的な判断材料になることはあります。

すでに若齢期に短日（秋の日長）を十分に経験している場合は、後から部屋の中などの暖かい場所に置いても、基本的には休眠（越冬）蛹になる可能性が高いです。例外的に代謝が上がりすぎて羽化してしまう個体が出る可能性もゼロではありませんが、基本は「日長」のプログラムが優先されます。